Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GGPS1O95749 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GGPS1O95749 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGPS1O95749 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GGPS1O95749 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGPS1O95749 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GGPS1O95749 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGPS1O95749 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGPS1O95749 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGPS1O95749 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GGPS1O95749 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGPS1O95749 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGPS1O95749 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GGPS1O95749 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGPS1O95749 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGPS1O95749 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGPS1O95749 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGPS1O95749 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGPS1O95749 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGPS1O95749 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGPS1O95749 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGPS1O95749 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms