Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN1O94985 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN1O94985 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLSTN1O94985 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms