Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM37O94972 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM37O94972 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM37O94972 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM37O94972 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM37O94972 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM37O94972 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM37O94972 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM37O94972 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM37O94972 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRIM37O94972 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms