Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCF11O94913 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCF11O94913 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PCF11O94913 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PCF11O94913 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PCF11O94913 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
PCF11O94913 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PCF11O94913 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PCF11O94913 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PCF11O94913 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PCF11O94913 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PCF11O94913 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PCF11O94913 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PCF11O94913 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PCF11O94913 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
PCF11O94913 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PCF11O94913 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PCF11O94913 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PCF11O94913 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PCF11O94913 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCF11O94913 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCF11O94913 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PCF11O94913 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
PCF11O94913 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PCF11O94913 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PCF11O94913 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PCF11O94913 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PCF11O94913 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PCF11O94913 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PCF11O94913 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PCF11O94913 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PCF11O94913 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PCF11O94913 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PCF11O94913 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PCF11O94913 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PCF11O94913 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
PCF11O94913 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
PCF11O94913 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PCF11O94913 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PCF11O94913 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PCF11O94913 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PCF11O94913 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PCF11O94913 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PCF11O94913 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PCF11O94913 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
PCF11O94913 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PCF11O94913 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PCF11O94913 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PCF11O94913 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PCF11O94913 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PCF11O94913 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PCF11O94913 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PCF11O94913 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PCF11O94913 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PCF11O94913 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PCF11O94913 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PCF11O94913 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PCF11O94913 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PCF11O94913 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PCF11O94913 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PCF11O94913 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PCF11O94913 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PCF11O94913 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PCF11O94913 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCF11O94913 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCF11O94913 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCF11O94913 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCF11O94913 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCF11O94913 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCF11O94913 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
PCF11O94913 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PCF11O94913 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
PCF11O94913 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PCF11O94913 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PCF11O94913 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
PCF11O94913 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
PCF11O94913 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PCF11O94913 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PCF11O94913 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PCF11O94913 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PCF11O94913 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PCF11O94913 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PCF11O94913 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PCF11O94913 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PCF11O94913 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PCF11O94913 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PCF11O94913 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PCF11O94913 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PCF11O94913 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PCF11O94913 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PCF11O94913 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PCF11O94913 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PCF11O94913 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PCF11O94913 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PCF11O94913 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PCF11O94913 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PCF11O94913 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PCF11O94913 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PCF11O94913 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PCF11O94913 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms