Protein–RNA interactions for Protein: O75112

LDB3, LIM domain-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB3O75112 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB3O75112 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB3O75112 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB3O75112 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB3O75112 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB3O75112 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB3O75112 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB3O75112 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB3O75112 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB3O75112 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB3O75112 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB3O75112 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB3O75112 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB3O75112 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB3O75112 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB3O75112 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB3O75112 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB3O75112 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB3O75112 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB3O75112 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB3O75112 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB3O75112 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB3O75112 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB3O75112 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB3O75112 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB3O75112 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB3O75112 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB3O75112 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB3O75112 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB3O75112 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB3O75112 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB3O75112 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB3O75112 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB3O75112 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB3O75112 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB3O75112 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB3O75112 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB3O75112 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB3O75112 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB3O75112 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB3O75112 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB3O75112 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB3O75112 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB3O75112 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB3O75112 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB3O75112 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB3O75112 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB3O75112 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB3O75112 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB3O75112 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB3O75112 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB3O75112 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB3O75112 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB3O75112 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB3O75112 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB3O75112 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDB3O75112 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB3O75112 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB3O75112 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB3O75112 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB3O75112 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB3O75112 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB3O75112 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB3O75112 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB3O75112 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB3O75112 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB3O75112 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB3O75112 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB3O75112 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB3O75112 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB3O75112 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB3O75112 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB3O75112 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB3O75112 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms