Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PLXNC1O60486 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PLXNC1O60486 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PLXNC1O60486 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PLXNC1O60486 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PLXNC1O60486 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms