Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZEB2O60315 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZEB2O60315 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZEB2O60315 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ZEB2O60315 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZEB2O60315 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZEB2O60315 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZEB2O60315 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZEB2O60315 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZEB2O60315 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZEB2O60315 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZEB2O60315 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZEB2O60315 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZEB2O60315 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZEB2O60315 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZEB2O60315 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZEB2O60315 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZEB2O60315 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZEB2O60315 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZEB2O60315 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZEB2O60315 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZEB2O60315 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZEB2O60315 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZEB2O60315 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZEB2O60315 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZEB2O60315 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZEB2O60315 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZEB2O60315 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ZEB2O60315 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZEB2O60315 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB2O60315 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms