Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SPAG9O60271 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SPAG9O60271 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SPAG9O60271 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
SPAG9O60271 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SPAG9O60271 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SPAG9O60271 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms