Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX1O43933 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX1O43933 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX1O43933 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX1O43933 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX1O43933 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX1O43933 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX1O43933 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX1O43933 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX1O43933 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX1O43933 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX1O43933 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX1O43933 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX1O43933 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX1O43933 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX1O43933 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX1O43933 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX1O43933 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX1O43933 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX1O43933 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX1O43933 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX1O43933 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX1O43933 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX1O43933 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX1O43933 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX1O43933 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX1O43933 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX1O43933 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX1O43933 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX1O43933 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX1O43933 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX1O43933 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX1O43933 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX1O43933 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX1O43933 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX1O43933 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX1O43933 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX1O43933 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX1O43933 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX1O43933 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX1O43933 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX1O43933 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX1O43933 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX1O43933 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX1O43933 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX1O43933 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX1O43933 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX1O43933 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX1O43933 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX1O43933 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX1O43933 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX1O43933 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX1O43933 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX1O43933 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX1O43933 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX1O43933 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX1O43933 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX1O43933 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX1O43933 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX1O43933 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX1O43933 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX1O43933 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX1O43933 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX1O43933 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX1O43933 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX1O43933 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX1O43933 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms