Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPRY3O43610 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPRY3O43610 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms