Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRS3O43559 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRS3O43559 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRS3O43559 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRS3O43559 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRS3O43559 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRS3O43559 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRS3O43559 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRS3O43559 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRS3O43559 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRS3O43559 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRS3O43559 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRS3O43559 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRS3O43559 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRS3O43559 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRS3O43559 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRS3O43559 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRS3O43559 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRS3O43559 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRS3O43559 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRS3O43559 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRS3O43559 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRS3O43559 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRS3O43559 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRS3O43559 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRS3O43559 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRS3O43559 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRS3O43559 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRS3O43559 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRS3O43559 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRS3O43559 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRS3O43559 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRS3O43559 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRS3O43559 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRS3O43559 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRS3O43559 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRS3O43559 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRS3O43559 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRS3O43559 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRS3O43559 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRS3O43559 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRS3O43559 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRS3O43559 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRS3O43559 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRS3O43559 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRS3O43559 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRS3O43559 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRS3O43559 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRS3O43559 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRS3O43559 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRS3O43559 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRS3O43559 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRS3O43559 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRS3O43559 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRS3O43559 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRS3O43559 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRS3O43559 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRS3O43559 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRS3O43559 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRS3O43559 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRS3O43559 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRS3O43559 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRS3O43559 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRS3O43559 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRS3O43559 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRS3O43559 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRS3O43559 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRS3O43559 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRS3O43559 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRS3O43559 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRS3O43559 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRS3O43559 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRS3O43559 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRS3O43559 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRS3O43559 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRS3O43559 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRS3O43559 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRS3O43559 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRS3O43559 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FRS3O43559 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRS3O43559 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRS3O43559 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRS3O43559 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRS3O43559 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRS3O43559 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRS3O43559 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRS3O43559 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRS3O43559 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRS3O43559 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRS3O43559 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms