Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIPK2O43353 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK2O43353 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK2O43353 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms