Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSI1O43347 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSI1O43347 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSI1O43347 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MSI1O43347 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSI1O43347 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSI1O43347 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSI1O43347 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSI1O43347 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSI1O43347 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSI1O43347 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSI1O43347 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSI1O43347 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSI1O43347 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSI1O43347 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSI1O43347 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSI1O43347 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSI1O43347 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSI1O43347 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSI1O43347 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSI1O43347 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSI1O43347 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSI1O43347 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSI1O43347 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSI1O43347 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSI1O43347 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSI1O43347 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSI1O43347 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSI1O43347 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSI1O43347 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSI1O43347 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSI1O43347 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSI1O43347 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSI1O43347 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSI1O43347 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSI1O43347 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSI1O43347 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSI1O43347 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSI1O43347 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSI1O43347 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MSI1O43347 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSI1O43347 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSI1O43347 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSI1O43347 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSI1O43347 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSI1O43347 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSI1O43347 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSI1O43347 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MSI1O43347 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSI1O43347 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSI1O43347 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MSI1O43347 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSI1O43347 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSI1O43347 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSI1O43347 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSI1O43347 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSI1O43347 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSI1O43347 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSI1O43347 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSI1O43347 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSI1O43347 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSI1O43347 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSI1O43347 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSI1O43347 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSI1O43347 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSI1O43347 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSI1O43347 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSI1O43347 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSI1O43347 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSI1O43347 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSI1O43347 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSI1O43347 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSI1O43347 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSI1O43347 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSI1O43347 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSI1O43347 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSI1O43347 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSI1O43347 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSI1O43347 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSI1O43347 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSI1O43347 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms