Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCP110O43303 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCP110O43303 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCP110O43303 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCP110O43303 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCP110O43303 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCP110O43303 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCP110O43303 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCP110O43303 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCP110O43303 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCP110O43303 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCP110O43303 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCP110O43303 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCP110O43303 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCP110O43303 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCP110O43303 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCP110O43303 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCP110O43303 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCP110O43303 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCP110O43303 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCP110O43303 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCP110O43303 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCP110O43303 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCP110O43303 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCP110O43303 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCP110O43303 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCP110O43303 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCP110O43303 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCP110O43303 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCP110O43303 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCP110O43303 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCP110O43303 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCP110O43303 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCP110O43303 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCP110O43303 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCP110O43303 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCP110O43303 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCP110O43303 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCP110O43303 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCP110O43303 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCP110O43303 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCP110O43303 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCP110O43303 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCP110O43303 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCP110O43303 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCP110O43303 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCP110O43303 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCP110O43303 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCP110O43303 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCP110O43303 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCP110O43303 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCP110O43303 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCP110O43303 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCP110O43303 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCP110O43303 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCP110O43303 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCP110O43303 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCP110O43303 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCP110O43303 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCP110O43303 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCP110O43303 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCP110O43303 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCP110O43303 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCP110O43303 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCP110O43303 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCP110O43303 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCP110O43303 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCP110O43303 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCP110O43303 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCP110O43303 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCP110O43303 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCP110O43303 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCP110O43303 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCP110O43303 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCP110O43303 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCP110O43303 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCP110O43303 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCP110O43303 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCP110O43303 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCP110O43303 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCP110O43303 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCP110O43303 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCP110O43303 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCP110O43303 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCP110O43303 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCP110O43303 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCP110O43303 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCP110O43303 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCP110O43303 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCP110O43303 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCP110O43303 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCP110O43303 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCP110O43303 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCP110O43303 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCP110O43303 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCP110O43303 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCP110O43303 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCP110O43303 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCP110O43303 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCP110O43303 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms