Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC3O15438 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCC3O15438 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC3O15438 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC3O15438 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC3O15438 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms