Protein–RNA interactions for Protein: O15344

MID1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1O15344 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MID1O15344 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MID1O15344 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MID1O15344 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MID1O15344 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MID1O15344 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MID1O15344 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MID1O15344 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1O15344 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1O15344 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MID1O15344 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1O15344 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1O15344 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MID1O15344 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1O15344 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1O15344 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1O15344 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1O15344 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1O15344 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1O15344 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1O15344 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MID1O15344 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1O15344 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1O15344 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1O15344 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1O15344 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MID1O15344 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MID1O15344 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1O15344 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1O15344 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1O15344 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1O15344 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1O15344 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MID1O15344 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1O15344 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1O15344 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1O15344 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1O15344 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1O15344 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1O15344 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1O15344 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1O15344 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1O15344 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1O15344 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1O15344 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1O15344 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MID1O15344 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MID1O15344 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MID1O15344 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MID1O15344 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MID1O15344 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1O15344 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1O15344 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1O15344 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1O15344 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1O15344 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1O15344 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1O15344 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1O15344 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1O15344 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1O15344 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1O15344 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1O15344 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1O15344 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1O15344 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1O15344 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1O15344 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1O15344 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1O15344 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1O15344 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1O15344 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1O15344 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1O15344 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1O15344 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1O15344 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1O15344 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1O15344 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1O15344 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1O15344 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1O15344 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1O15344 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms