Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA5O15230 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA5O15230 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA5O15230 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms