Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2LO15068 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2LO15068 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2LO15068 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2LO15068 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2LO15068 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms