Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC16AO15027 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC16AO15027 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms