Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAMP3O14828 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAMP3O14828 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAMP3O14828 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms