Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB6O14558 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB6O14558 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms