Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBAG9O00559 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms