Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A7O00341 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A7O00341 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A7O00341 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms