Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4O00268 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4O00268 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4O00268 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4O00268 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4O00268 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4O00268 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4O00268 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4O00268 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4O00268 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4O00268 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4O00268 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4O00268 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4O00268 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4O00268 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4O00268 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4O00268 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4O00268 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4O00268 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4O00268 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4O00268 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4O00268 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4O00268 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4O00268 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4O00268 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4O00268 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4O00268 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4O00268 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4O00268 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4O00268 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF4O00268 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF4O00268 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF4O00268 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF4O00268 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF4O00268 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF4O00268 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF4O00268 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF4O00268 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF4O00268 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF4O00268 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF4O00268 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF4O00268 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF4O00268 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF4O00268 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF4O00268 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF4O00268 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF4O00268 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF4O00268 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF4O00268 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF4O00268 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF4O00268 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF4O00268 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF4O00268 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF4O00268 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF4O00268 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF4O00268 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF4O00268 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF4O00268 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF4O00268 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF4O00268 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF4O00268 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF4O00268 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF4O00268 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF4O00268 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF4O00268 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF4O00268 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF4O00268 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF4O00268 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF4O00268 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF4O00268 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4O00268 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4O00268 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4O00268 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4O00268 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4O00268 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4O00268 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF4O00268 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF4O00268 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF4O00268 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF4O00268 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF4O00268 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF4O00268 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4O00268 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4O00268 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4O00268 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4O00268 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4O00268 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4O00268 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms