Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRDCB7Z8K6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms