Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRM3A6NNA2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRM3A6NNA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRM3A6NNA2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms