Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6BA6NDN3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms