Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00862A6NCI5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00862A6NCI5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms