Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF27A3QJZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF27A3QJZ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms