Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND3A2RUS2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DENND3A2RUS2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DENND3A2RUS2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND3A2RUS2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms