Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIPSLA2A3N6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIPSLA2A3N6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIPSLA2A3N6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIPSLA2A3N6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms