Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN11A1L157 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN11A1L157 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TSPAN11A1L157 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSPAN11A1L157 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN11A1L157 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN11A1L157 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN11A1L157 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN11A1L157 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN11A1L157 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms