Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2C4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2C4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0B4J2C4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0B4J2C4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms