Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
A0A087WWV3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A087WWV3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A087WWV3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms