Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYY5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYY5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYY5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYY5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms