Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUBP2Q9Y5Y2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms