Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1Q9Y3L3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms