Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms