Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms