Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FBXL4Q9UKA2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms