Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GGA1Q9UJY5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms