Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms