Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT172Q9UG01 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms