Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DBF4Q9UBU7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms