Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJB11Q9UBS4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms