Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms