Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms