Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX55

HYPK, Huntingtin-interacting protein K, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HYPKQ9NX55 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HYPKQ9NX55 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms