Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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