Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms